整个剧情更像是单线的剧情。一切的故事发生在这个叫天秤琉璃学院的地方。这是一个魔法存在的校园。魔法道具-遗品会响应人们的愿望而出现在他们的面前。这个学院的普通学生并不知道魔法的存在-除了风纪委员和特别事件调查室。特别事件调查室的任务便是回收被学生们无意间召唤出来的各种遗品。到了晚上，这个学校会变成夜之学院，会有夜之学生来上课。夜之学生看上去和普通人无疑。风纪委员的任务除了维持校园的和平，便是在天黑之前把昼之学院的学生赶回宿舍。
这个游戏的主线便是探寻夜之学院的秘密。在第一部《黄昏时的境界线》中，主角探索到了实现夜之学院的魔法。在第二部《残影之夜将明时》中，主角破坏了夜之学院的魔法仪式，他们认识到了夜之学院魔法仪式的目的，他们也发现了一切都跟二十年前的火灾有关。在第三部《朝雾中飘零之花》中，主角们开始探索二十年前的真相，对抗想要发动夜之学院魔法仪式的势力。最后寻找到了更好的解决方法，解决了事件，也与敌人握手言和。虽然这也不算强行HE，毕竟伏笔在《黄昏时的境界线》中就已经埋下了。但是总觉得，整部游戏的矛盾不够突出，道德立场上的矛盾完全没有被阐述清楚。导致HE完全没有柳暗花明的又一村的感觉。类似是做一道关键的选择题。有两个选项A和B。A和B感觉以前都比较熟悉。那就选B了，做出选择后突然发现这其实是一道双选题。故事中的选择本应该是一个两难的问题。二十年前的人由于灾难奄奄一息，二十年后我们找到了解决方案。需要类似献祭一部分人去挽救二十年前由于事故奄奄一息的生命。然后主角就毫不犹豫的选择牺牲二十年前的人。这阵营绝对属于守序阵营啊。估计是守序中立。一切都按照规则办事。一个好好的道德抉择，就这样没被写好。还是挺遗憾的。
整个游戏的关键人物安蒂儿直到最后才出现。总觉得感觉跟出来救场的一样。火灾时她引发的，要求拯救二十年前学生的命令是她下的。估计在她眼里，救谁都是一样的，谁都不救也无所谓。总感觉她最后出现的目的只是单纯的解释一下真相，HE一下。有点尴尬。。不过这一作的人物塑造都有点失败，唯一比较好的估计就是莉塔了。人工生命体，只要根据命令做出行动就好了。没有灵魂，没有性格的人物，却是这个游戏中塑造的比较好的人物形象。
游戏节奏的槽点也很大，第一部实在是对主线的推进过于缓慢。最后一步几乎全程都是在打boss，解决最终事件。还有那个白开水一般的回收遗品日常。虽说有一个铺垫的效果，但是这个剧情是真的无聊而且没有悬念。都是在学院里走两圈，问莉塔，无外乎那几种方式。
整个游戏的声优也有点差劲。尤其是作为正牌女主角的鹿谷忧绪的CV，实在是听不下去，语调和语气实在是有点出戏。唯一听着比较棒的就是学院长的声优小倉結衣的演绎还是挺不错的。音乐感觉也有些不搭配。虽说是水月陵的作曲，水平不差。但是总感觉和游戏不搭配。不像《想要传达给你的爱恋》那般的和谐。水月陵用了很多的小提琴之类，贝斯之类的乐器。让整个音乐风格显得沉重，仿佛有一个拯救世界的使命在等着玩家。然而游戏却没有透露出这样沉重的使命感，有点儿戏的日常封印遗品。 完全由奇怪的道德所驱使的行动，让剧情与沉重的音乐风格不搭配。
还有个槽点就是感情线。烂的一塌糊涂。在第三部《朝雾中飘零之花》中，作者成功的把感情线从主线中给掐掉了。将所有的支线放到了另外的“Another Story”。所以“Another story”中有相比前作稍微好一些的莉塔线（虽然还是有点烂），还有各种奇奇怪怪不符合剧情逻辑的HS。什么和学院长的play，两个魔女的百合，睦月，忧绪的双飞。即使我知道Another Story的质量有点。。。，一路c了过去，但还是受到了san check。
这个系列的主旨应该是人工生命体。人工生命体与人类最大区别在于感情。如果将人工生命体当做工具来使用，那么它们能够出色的完成绝大部分的任务。但是，如果把它们当做朋友对待，那么它们会带来不幸。游戏中也对其进行了解释，因为人工生命体会不惜一切手段来完成主人的命令。没有情感的它们有时候会曲解主人的意思，存在断章取义这样的情况。即使游戏中安蒂尔创造了除了有灵魂的人工生命体，最后人工生命体带来的也是不幸。它对安蒂尔命令的坚持。即使在孤独中度过的岁月磨灭了它的记忆，到底是谁命令它拯救那些学生，又为什么要拯救。最后的它走上了牺牲其他人来拯救这写学生的道路。虽然最为一个混乱善良阵营的人，我觉得这种做法也无可厚非。毕竟总是要把事情所解决的，因为20年前的学生是因它而遭遇这些灾难。的确在游戏中，不管是有没有灵魂的人工生命体都处处体现着与人类的不同。关键在于两点，人这个定义具有排他性，只有人能称之为人。第二，人工生命体有着主人这样的枷锁。你无法判断它有没有说一些与事实不符的事情。
这让我想起了《VA-11 Hall-A》中的机器人。他们与人类不同，他们在一些地方比人类更加出色，毕竟身体是可以改造的。他们对死亡的理解与人类不同。因为他们的记忆是可以上传到云端的，然后他们可以再次被制造出来。但是它们却与人类和谐相处，有着自己的特色。Dorothy也有着各种各样的烦恼，也质疑过自己的实在与存在。与《A Clockwork Ley-line》中人工生命体的区别是自由。《VA-11 Hall-A》中的机器人能够自由的思考，它们可以去考虑自己存在的原因。也许是这样自由的思考，自由的思考自己是什么造就了人工智能与人类最后的一些差异。